Ökosystem ist der Komplex aus Biotop und der darin existierenden Biocoenose. Meistens wird umgangssprachlich darunter ein größerer Komplex verwandter Biotope und Biocoenosen verstanden. Ähnlich wie beim "Biotop" ist der Begriff dadurch so unscharf geworden, dass er in der praktischen ökologischen Arbeit kaum noch sinnvoll verwendbar ist.